2016年12月，南沙海港公司迎來三條新東非航線首航，加上現有的一條東非線EA2，使得南沙駛往東非的航線達到每周四班。新開航線的具體情況如下：
??? 12月6日，馬士基東非線MASX首航船“EXPRESS SPAIN”成功掛靠我司，該輪載箱能力為3510TEU。據悉，馬士基在MASX線上共投放了7艘3510TEU級集裝箱船，每周二掛靠南沙，掛靠港序為寧波→南沙→新加坡→蒙巴薩→達累斯薩拉姆→丹戎帕拉帕斯→寧波。
??? 12月11日，太平船務、中遠海運集運共同投船的東非1線EAS首航船“KOTA LAZIM”成功掛靠我司，該輪載箱能力為4253TEU。據悉，在EAS線上太平船務共投放了4艘、中遠海運集運共投放了3艘，合計7艘4250TEU級集裝箱船，每周日西行掛靠南沙，每周三東行掛靠南沙，掛靠港序為：青島，上海，寧波，南沙，新加坡，蒙巴薩，新加坡，南沙，青島。
??? 12月16日，太平船務東非莫桑比克線MZS首航船“KOTA NEBULA”成功掛靠我司，該輪載箱能力為1810TEU。據悉，太平船務在MZS線上共投放了9艘1800TEU級集裝箱船，每周五掛靠南沙，掛靠港序為：上海→寧波→汕頭→南沙→新加坡→路易港/路易斯港→留尼汪→塔馬塔夫→馬普托→貝拉→那卡拉→新加坡→黃埔→上海。
又訊，12月13日起，太平船務與中遠海運集運對其共同經營的EA2線進行了掛港調整，調整后，EA2每周二掛靠南沙，掛港順序為：大連→天津新港→寧波→南沙→新加坡→科倫坡→蒙巴薩→達累斯薩拉姆→科倫坡→帕西古當→新加坡→達沃→上海→大連。
??? 截至目前，南沙至非洲東岸的航線網絡已覆蓋東非肯尼亞、坦桑尼亞、毛里求斯、法屬留尼旺、馬達加斯加、莫桑比克等國家的各主要碼頭。
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